009 Re:Cyborg follows a group of nine cyborgs, each of them created by a shadowy organization for use as weapons against humanity. The group turns on their creators to protect the population instead, using the powers given them to fight their creators.
2029: O agentă guvernamentală cibernetică, maiorul Motoko Kusanagi, și Biroul Intern de Investigații sunt pe urmele „Maestrului Păpușar”, un virus misterios și amenințător de pe computer, capabil să se infiltreze în gazde umane.
Când galeonul spațial Jim Hawkins descoperă o hartă către o „pradă a o mie de lumi” intergalactică, un bucătar cyborg pe nume John Silver îl învață să lupte cu supernove și furtunile spațiale în călătoria lor pentru a găsi comori.